Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ncoa4Q5U4H9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ncoa4Q5U4H9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ncoa4Q5U4H9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms