Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Gprasp1Q5U4C1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gprasp1Q5U4C1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms