Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccdc125Q5U465 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc125Q5U465 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms