Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ubr3Q5U430 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ubr3Q5U430 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ubr3Q5U430 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms