Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r196Q5SVD5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r196Q5SVD5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms