Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SynrgQ5SV85 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SynrgQ5SV85 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynrgQ5SV85 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynrgQ5SV85 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SynrgQ5SV85 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms