Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccdc42Q5SV66 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc42Q5SV66 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms