Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Ankrd40Q5SUE8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ankrd40Q5SUE8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms