Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Fam71bQ5STT6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Fam71bQ5STT6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms