Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trdv2-2Q5R1A4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trdv2-2Q5R1A4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms