Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

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Length 1,064 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrc3Q5DU56 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms