Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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Rtl5Q5DTT4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rtl5Q5DTT4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rtl5Q5DTT4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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