Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Eme2Q56A04 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Eme2Q56A04 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms