Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Pdp2Q504M2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pdp2Q504M2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pdp2Q504M2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Pdp2Q504M2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Pdp2Q504M2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pdp2Q504M2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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