Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Shank3Q4ACU6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Shank3Q4ACU6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms