Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Snx25Q3ZT31 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snx25Q3ZT31 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Snx25Q3ZT31 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Snx25Q3ZT31 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Snx25Q3ZT31 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Snx25Q3ZT31 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx25Q3ZT31 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Snx25Q3ZT31 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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