Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
6430531B16RikQ3V2J1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms