Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ulk4Q3V129 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ulk4Q3V129 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms