Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc185Q3V118 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc185Q3V118 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms