Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ldlrad2Q3V0V0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ldlrad2Q3V0V0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms