Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV9

Ncbp1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp1Q3UYV9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncbp1Q3UYV9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ncbp1Q3UYV9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms