Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc160Q3UYG1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms