Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms