Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Clca4bQ3UW98 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Clca4bQ3UW98 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms