Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Defb48Q3UW22 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Defb48Q3UW22 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms