Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clpsl2Q3UW21 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clpsl2Q3UW21 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms