Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Syndig1lQ3USQ7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Syndig1lQ3USQ7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms