Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fchsd2Q3USJ8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fchsd2Q3USJ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fchsd2Q3USJ8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms