Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc190Q3URK1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc190Q3URK1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc190Q3URK1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc190Q3URK1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc190Q3URK1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms