Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vwa5b2Q3UR50 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Vwa5b2Q3UR50 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms