Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nhlrc4Q3UP44 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nhlrc4Q3UP44 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms