Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hdgfl2Q3UMU9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdgfl2Q3UMU9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms