Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Mccc2Q3ULD5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mccc2Q3ULD5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms