Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc34Q3UI66 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccdc34Q3UI66 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms