Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmed8Q3UHI4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmed8Q3UHI4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms