Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf180Q3U827 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Rnf180Q3U827 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf180Q3U827 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms