Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ssbp4Q3U4B1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssbp4Q3U4B1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms