Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hectd3Q3U487 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hectd3Q3U487 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms