Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Kdm4dQ3U2K5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Kdm4dQ3U2K5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms