Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pag1Q3U1F9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pag1Q3U1F9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms