Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hace1Q3U0D9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hace1Q3U0D9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms