Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXT3

Inip, SOSS complex subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InipQ3TXT3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
InipQ3TXT3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
InipQ3TXT3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms