Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Ccdc136Q3TVA9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Ccdc136Q3TVA9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Ccdc136Q3TVA9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms