Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT38

D17Wsu92e, Uncharacterized protein C6orf106 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D17Wsu92eQ3TT38 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
D17Wsu92eQ3TT38 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms