Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xlr4cQ3TKR2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Xlr4cQ3TKR2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms