Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cers3Q1A3B0 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cers3Q1A3B0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cers3Q1A3B0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms