Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam171bQ14CH0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam171bQ14CH0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms