Protein–RNA interactions for Protein: Q149F5

Tmem71, Transmembrane protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem71Q149F5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem71Q149F5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem71Q149F5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem71Q149F5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem71Q149F5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem71Q149F5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem71Q149F5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem71Q149F5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tmem71Q149F5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms