Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc162pQ0VG85 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ccdc162pQ0VG85 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms