Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Samd12Q0VE29 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Samd12Q0VE29 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms